En el 2005, como producto del proyecto Mina Marlin I, se realizó en Sipakapa una Consulta Comunitaria en donde 99% se pronunció en contra de la Minería. No tomando en cuenta esa posición comunal, en el 2012 el Ministerio de Energía y Minas de Guatemala (MEM) otorgó la licencia de exploración Los Chocoyos a la empresa Entre Mares de Guatemala subsidiaria de Gold Corp. Este proyecto es la ampliación de Mina Marlin y consiste en la exploración de oro, plata y otros metales. La licencia fue aprobada por un período de tres años.
Como producto de la Mina Marlin, en el 2010, La Comisión Interamericana de Derechos Humanos (CIDH) dictó medidas cautelares a favor de 18 comunidades mayas en San Miguel Ixtahuacán y Sipacapa pero han sido incumplidas por el gobierno guatemalteco. Muestra de ello es el otorgamiento de licencias como Los Chocoyos.
En junio del 2012, alrededor de 4000 personas de distintos pueblos de San Marcos, junto con el Consejo del Pueblo Maya Mam y el Consejo de Pueblos de Occidente, marcharon en contra de la licencia de exploración. Ese mismo año se realizó el Tribunal Popular de la Salud, en donde una de las conclusiones fue que las afecciones a la salud en Mina Marlin forman parte de los impactos de la minería en Sipakapa. Las comunidades locales reportan: “enfermedades de la piel, de los ojos, caída de pelo, picazón en el cuerpo, abortos, infertilidad, partos prematuros, defectos congénitos y muerte de recién nacidos, daños auditivos, problemas gastro-intestinales, dolores de articulaciones, problemas nerviosos, y casos de intoxicación que han llevado a la muerte“ una alegación más que utilizan los indígenas mayas para oponerse a la ampliación de la Mina.
En diciembre de 2013, el Consejo, presentó una acción constitucional de amparo ante la Corte de Apelaciones; para que de manera legal y pacífica se anulara dicha licencia minera y se respetaran los títulos de propiedad colectiva que tienen los indígenas maya sipakaense y la consulta realizada en el 2005. En marzo de 2014 la Sala resuelve a favor del Consejo Maya. Actualmente el proyecto continúa en fase de exploración.
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